孝宗仿古天子亲耕籍田（古代天子、诸侯征用民力耕种的田。每逢春耕前,天子、诸侯躬耕藉田,以示对农业的重视），教坊进献杂戏。文升严肃地说：“新任天子应当知道农事的艰难，这些杂戏是什么意思？”就斥退了他们。第二年，担任兵部尚书，仍像以前那样督率团营（明自土木之役后，京军三大营——五军﹑三千﹑神机——损失殆尽。景泰中，于谦从三营中选精兵十万，分十营集中操练，称为团营。嘉靖时罢团营，恢复旧制）。当时天下持久太平、兵备荒废松弛、西北部落少数民族时时伺机入侵。文升严格考查将校，贬退三十余个贪婪懦弱的军官，奸人对他十分怨恨，夜间持弓等在他门旁，有的写谤书射入东长安门内。马文升在兵部任职十三年，尽心军务，对于屯田、马政、边备、守御等事务，他多次上书分条陈奏。只要是应当说明的国家大事，即使并非他的本职，也言无不尽，曾经因为太子年已四岁，应该及早进行教育。文升请求挑选淳朴严谨、老成又熟悉历史的人，教育扶持太子，对太子言语举止都要正确引导。山东久旱无雨，浙江以及南畿发生水灾，马文升奏请命有关部门救济抚恤，操练士卒以备不测。皇帝都完全接纳。他在朝班的行列中最为德高望重，皇帝也以诚相待十分信任他。诸大臣没人敢有怨言。吏部尚书屠滽被罢免，倪岳取代了屠滽，倪岳去世，由马文升代替倪岳任吏部尚书。南京、凤阳发生大风雨，房屋被毁坏，树木被拔起，马文升请求皇帝减少饮食撤去歌舞音乐，修养德行反省过失，开御前讲席，断绝游玩和宴饮，停办并不紧急的事务，停止额外织造，赈济灾民，捕捉盗贼。事后，文升又奏陈吏部主管的十件事。孝宗全都表示赞赏并接纳之。正德年间，朝政已转移到宦官手里，文升年老，接连上疏要求离开，皇帝答应了。文升在家居住时，无事不去州府。外人谈及时事，他总是皱着眉头不回答。五年去世，终年八十五岁。文升有文武两方面的才能，擅长应变，朝廷中的大事往往要等他来做决定。他在边疆建立功勋，外国都知道他的名声。尤其看重气节，砥砺操守（厉，同“砺”廉隅，棱角，比喻指(zhi)方正的操守(shou)），行事坚(jian)守(shou)正道。他(ta)去世一年后，大盗到了(le)(le)钧州，因为(wei)马文升的家在此地，即放弃了(le)(le)那里(li)离(li)开了(le)(le)。
